Biomonitoreo: seguimiento de poblaciones microbianas en procesos de biorremediación de suelos contaminados con hidrocarburos Public Deposited
Los suelos están constituidos por una microbiota compleja difícil de cultivar mediante el uso de métodos convencionales. La ecología molecular microbiana permite el estudio de la diversidad de las interacciones entre las comunidades microbianas y su ambiente. Existen determinadas alternativas para conocer la estructura microbiana, una de ellas consiste en aislar los microorganismos y tipificarlos mediante técnicas de biología molecular. Para incluir la detección de microorganismos no cultivables o aún no cultivados, se utilizan métodos en los que se extraen los ácidos nucleicos directamente de los suelos y a partir de éstos se determina la diversidad microbiana. En este trabajo se estudiaron muestras de suelos contaminados con petróleo de Huimanguillo, Tabasco y de Poza Rica, Veracruz; se cuantificó la cantidad de UFC/g de suelo de las bacterias totales y de las bacterias hidrocarbonoclastas, de estas últimas se aislaron algunas cepas. A partir del suelo de Tabasco se aislaron 7 cepas degradadoras de hidrocarburos y 21 cepas hidrocarbonoclastas del suelo de Poza Rica, Ver. Estas últimas se identificaron por galerías API 20 NE y se encontraron los siguientes microorganismos: 3 cepas de Stenotrophomonas maltophilia; 3 cepas de Sphingomonas paucimobilis; dos cepas de Chryseomonas luteola; 3 cepas de Burkholderia cepacia y dos cepas de Agrobacterium radiobacter. Se extrajo DNA de los suelos contaminados y se obtuvieron productos de amplificación por PCR para el gen completo 16S rRNA, así como para la región V6-V8 de este mismo gen y para la región intergénica del operón rrn. Se realizó el análisis de restricción enzimática (REA) del espacio intergénico del operón rrn, a las 21 cepas degradadoras de Poza Rica, Veracruz. La tipificación PCR-REA permitió agrupar en 18 grupos diferentes a las cepas hidrocarbonoclastas aisladas. Del suelo de Poza Rica, se montó una biopila de biorremediación y a lo largo de 2 meses, se analizaron los patrones de bandas de DNA de las poblaciones presentes por el método de DGGE. Con estos resultados se estudió el dinamismo, estructura y diversidad de la comunidad bacteriana presente en la biopila.
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